چه باید بدانیم
- فایل FNA یک فایل DNA با فرمت FASTA و ترازبندی توالی پروتئین است.
- یکی را با Geneious باز کنید.
- تبدیل به FASTA و فرمت های مشابه با همان برنامه.
این مقاله توضیح می دهد که یک فایل FNA چیست، چگونه می توان آن را باز کرد و چگونه آن را در فرمت های مختلف مانند FASTA، GB، VCF، تصاویر و غیره ذخیره کرد.
فایل FNA چیست؟
فایل با پسوند فایل FNA یک فایل DNA با فرمت FASTA و تراز توالی پروتئین است که اطلاعات DNA را ذخیره می کند که می تواند توسط نرم افزار زیست شناسی مولکولی استفاده شود.
فایل‌های FNA، به طور خاص، ممکن است فقط برای نگهداری اطلاعات اسید نوکلئیک استفاده شوند، در حالی که سایر قالب‌های FASTA حاوی اطلاعات مرتبط با DNA هستند، مانند مواردی که دارای FASTA، FAS، FA، FFN، FAA، FRN، MPFA، SEQ هستند. پسوند فایل، NET، یا AA.
این قالب‌های FASTA مبتنی بر متن در ابتدا از یک بسته نرم‌افزاری با همین نام به وجود آمدند، اما اکنون به‌عنوان استاندارد در برنامه‌های همترازی توالی DNA و پروتئین استفاده می‌شوند.
FNA همچنین به برخی از اصطلاحات فناوری اشاره دارد که هیچ ارتباطی با این فرمت فایل ندارند، مانند پذیرش نهایی شبکه، تسهیلات افزایش نام/ویژگی فایل، معماری شبکه فوجیتسو، و تبلیغات سریع همسایه.
چگونه یک فایل FNA را باز کنیم
یکی را در Windows، macOS و Linux با Geneious باز کنید (به مدت 14 روز رایگان است). برای انجام این کار، به منوی File > Import بروید و وارد کردن فایل از طریق From File را انتخاب کنید.مورد منو.
همچنین ممکن است بتوانید یکی را با BLAST Ring Image Generator (BRIG) باز کنید.
اگر این ایده ها جواب نداد، Notepad++ یا ویرایشگر متن دیگری را امتحان کنید. ممکن است فایل در واقع مبتنی بر متن باشد و خواندن آن ساده باشد، یا ممکن است متوجه شوید که هیچ ارتباطی با فرمت FASTA ندارد، در این صورت باز کردن فایل به عنوان یک سند متنی ممکن است متنی را نشان دهد که مشخص می کند چه چیزی برای ایجاد فایل استفاده شده است. یا فایل با چه فرمتی است.
چگونه یک فایل FNA را تبدیل کنیم
ما نمی‌توانیم این مورد را تأیید کنیم زیرا آن را امتحان نکرده‌ایم، اما باید بتوانید از Geneious برای تبدیل فایل به بسیاری از فرمت‌های دیگر مانند FASTA، GB، GENEIOUS، MEG، ACE، CSV، استفاده کنید. NEX، PHY، SAM، TSV و VCF. این را می توان از طریق منوی File > صادرات برنامه انجام داد.
همین برنامه همچنین باید بتواند فایل را در PNG، JPG، EPS یا PDF، از طریق File > ذخیره به عنوان فایل تصویری ذخیره کند..
اگرچه به طور معمول نمی توانید نام پسوند یک فایل را به چیز دیگری تغییر دهید و انتظار داشته باشید که به همان شیوه کار کند، می توانید نام یک فایل. FNA را به یک فایل. FA تغییر دهید اگر نرم افزار توالی یابی DNA خاص شما فقط آن را تشخیص دهد. قالب FA.
به جای تغییر نام پسوند فایل، می خواهید از یک مبدل فایل رایگان برای تبدیل انواع فایل های دیگر استفاده کنید. در مورد فایل‌های FNA و FA، اتفاقاً برخی از برنامه‌ها فقط فایل‌هایی را باز می‌کنند که پسوند فایل FA دارند، در این صورت تغییر نام آن باید به خوبی کار کند.
هنوز نمی توانید آن را باز کنید؟
اگر پس از استفاده از برنامه های بالا، باز هم نتوانید فایل خود را باز کنید، ممکن است متوجه شوید که پسوند فایل در واقع FNA. را نمی خواند، بلکه چیزی شبیه به نظر می رسد.
برای مثال، فایل‌های FNG (Font Navigator Group) بسیار شبیه به «. FNA» به نظر می‌رسند، اما اگر دقت کنید، فقط دو حرف اول یکسان هستند. از آنجایی که پسوند فایل‌ها متفاوت هستند، نشان‌دهنده آن است که فرمت فایل متفاوتی دارند و به احتمال زیاد با برنامه‌های مشابه کار نمی‌کنند.
همین را می توان برای بسیاری از پسوندهای فایل دیگر مانند FAX، FAS (کامپایل شده با بارگذاری سریع AutoLISP)، FAT، FNTA (فونت Aleph One)، FNC (توابع Vue) و FND (جستجوی ذخیره شده در ویندوز) گفت.
ایده در اینجا این است که فقط مطمئن شوید که پسوند فایل. FNA را می خواند. اگر چنین شد، دوباره سعی کنید از برنامه های بالا برای باز کردن یا تبدیل آن استفاده کنید. اگر نوع دیگری از فایل دارید، پسوند آن را بررسی کنید تا دریابید که کدام برنامه‌ها برای باز کردن یا تبدیل آن نیاز دارند.
سوالات متداول
چگونه یک فایل FNA را در پایتون باز می کنید؟
ابتدا، فایل FNA را با استفاده از یک برنامه شخص ثالث مانند Geneious به فرمت FASTA تبدیل کنید. سپس، می‌توانید Biopython، مجموعه‌ای از ابزارهای رایگان در دسترس برای محاسبات بیولوژیکی برای کار در بیوانفورماتیک را دانلود کنید. در نهایت، برای دستورالعمل‌های مربوط به کار با فایل‌های FASTA، به کتاب آموزش Biopython و کتاب آشپزی مراجعه کنید.
چگونه اعداد سازنده FNA خود را در فایل خام Ancestry پیدا کنم؟
می توانید بیشتر داده های DNA را از Ancestry.com با فرمت txt. دانلود کنید. با این حال، فقط مشتریانی که DNA آنها با توالی‌یابی نسل بعدی (NGS) آنالیز شده است، می‌توانند فایل VCF را دانلود کنند.برای دانلود فایل VCF، باید مالک DNA باشید، با استفاده از فناوری NGS آزمایش DNA انجام دهید و حداقل 350 مگابایت فضای موجود در دستگاه خود داشته باشید.
